乌鲁木齐海关努力克服“非典”疫情及国家边贸政策调整等对新疆外贸进出口的不利影响，不断加强物流监控，始终坚持综合治税，2003年监管货运量，征收税款双创历年最高。
根据该关《税分析监控系统》提供的数据，2003年1-12月，乌鲁木齐海关累计征收税款25.16亿元，同比增长61.0％，完
成全年税收计划的 104.8％，比计划进度多征收税款1.16亿元。其中关税4.07亿元，同比增长50.4％：进口环节税21.09亿元，同比增长63.2％。该关牢固树立税收“一盘棋”思想，坚持综合治税，努力建立税收征管长效机制，充分利用“关税分析与监控系统”、 “审价管理子系统”、 “加工贸易管理子系统”，对商品价格、税收进度、减免税政策执行情况等开展全方位监控分析，保证了税款应收尽收。同时，该关加大了对减免税货物的后续监管力度，强化对加工贸易的监督指导，分析监控和风险管理。2003年审价补税2085万元，加工贸易内销补税 1211万元，稽查补税39万元。
该关还制定了《物流数据监控规程及实施细则》，指定专人定期分析各类进出境运输工具信息，将数据监控和实际查验有机结合起来；完成了阿拉山口海关数字化物流监控系统工程评估验收工作，实现了对监管区域内各重点监控目标24小时实时监控；同时，为业务现场增配了地磅、射线剂量等监管查验设备，增强了监管一线的查验力量。1-12月，该关监管进出，口货运量798万吨；监管进出境运输工具33，76万辆(架)次；出入境人员5l.96万人次；查获违禁印刷品和音像制品6813件。
